Stončica se u kopno zavukla skoro pola milje pa je dobro zaštićena od svakog vjetra, osim od bure, što ju donekle čini jednom od najsigurnijih uvala Visa. To se svakako odnosi na njen južni dio gdje je dubina mora 5 do 6 metara, a udaljenost dviju obala oko 150 m. Dno je pjeskovito. Stončica je prvi izbor nautičara koji žele uživati u osami, a opet biti nadomak civilizacije.

Stončica je poznata i po jednom od najvećih pučinskih svjetionika na Jadranu, koji se visoko uzdiže nad niskim i isturenim rtom, kojim završava njena istočna obala. Na drugoj strani, tisuću metara zapadno, iz mora se u brdo uspinje rt Stracine, koji Stončicu, zaklanja od moćnih valova tramontane i poslijepodnevnog maestrala.